外泌体研究最新成果轻松到11分
外泌体无疑是这几年生物学研究中的一颗新星,无论是论文产出还是基金项目都呈现指数上升。它是细胞分泌的一种细胞外膜泡,具有脂质双分子层结构,含有多种蛋白质,核酸,脂质等成分,在疾病的诊断与治疗方面具有广阔的前景,虽说炒了好几年,但研究热度仍然不减。从下面两组数据我们可以更加清楚。
2000年以来外泌体研究的论文发表呈现逐年递增趋势。
近10年外泌体的资助项目数和资助金额整日呈上升趋势。
期刊名:Journalof extracellular vesicles
发表时间:2020年
单位:韩国浦项科技大学
影响因子:11分
文章概述
目前虽然建立了各种分离外泌体(EV)的方法,但大多数方法得到的外泌体都含有污染的非囊泡蛋白。本研究采用label free的蛋白质组学策略对前列腺癌细胞SW480的上清外泌体进行研究,鉴定胰蛋白酶敏感和耐胰蛋白酶的囊泡蛋白。通过蛋白-蛋白相互作用网络分析鉴定胰蛋白酶敏感和耐胰蛋白酶泡蛋白的细胞定位,揭示候选的真实囊泡蛋白和非囊泡蛋白,对囊泡的提取和纯化提供一定的价值。
主要研究结果
1.首先利用人的外泌体公用数据库EVpedia database (http://evpedia.info)来分析外泌体的亚细胞定位分布情况。
2.对加入和未加入胰蛋白酶的外泌体进行表征,包含电镜和粒径检测,对两种经常在EVs中被鉴定的蛋白进行Western blotting分析显示:ICAM1,一种具有胞外结构域的完整质膜蛋白,几乎被胰蛋白酶消化,而肌动蛋白,一种细胞质室内蛋白,则基本没有被消化。
3.紧接着对加入和未加入胰蛋白酶的外泌体进行labelfree蛋白质组学的研究,鉴定到的差异蛋白分别为163和228种。
4.常规套路对两组差异蛋白进行GO功能富集分析。
5.对蛋白质进行互作分析,并对这些差异蛋白的定位进行归类。来自细胞核、高尔基体、内质网和线粒体等胞内细胞器的蛋白质为污染的非囊泡蛋白。本研究发现对外泌体/囊泡进行胰蛋白酶处理,可以减少受污染的非囊泡蛋白的丰度,以此提高纯度。
全文下来,就是这么简单的蛋白组学+外泌体研究,轻松上11分,心动的话就行动起来吧。
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